蘭嶼鄉有著豐富自然景觀與獨特人文，是旅客心目中的觀光勝地，但長期以來因為天候、地形的特殊性，交通相當不便，島上醫療資源也受到影響與限制，為此，臺東縣府向衛福部爭取設置臺東醫院蘭嶼分院，並指示衛生局協助用地取得，經多次協調獲蘭嶼鄉公所同意撥用土地，對離島醫療意義重大。
衛生局表示，雖然離島門診與住院需求狀況，與臺灣本島大同小異，醫療資源也能因應常見病症所需，但礙於專科診察不足，以及衛生所不得設置住院病房規定，臺灣本島可在地治療的病症，離島居民須離鄉奔波回本島就醫，因此，在島上設置醫院是蘭嶼鄉親深切的盼望。
衛生局指出，衛福部在108年4月評估蘭嶼地區興建醫院可行性，並前往蘭嶼實地勘察合適用地，面臨用地稀少且取得困難，以及原保地撥用變更的繁瑣程序，於109年8月請縣府協助辦理「衛生福利部臺東醫院蘭嶼分院」籌建用地取得，併請評估將長照及衛生所納入整體規劃。
經多次會同衛福部及相關單位現地勘察，並收集部落意見，評估於衛生所現址及鄰近周邊共15筆土地進行擴建，獲多數民眾支持，且當地民眾、長者也習慣於該處就醫，用地也鄰近蘭嶼鄉公所、蘭嶼航空站，具備行政資源連繫與交通便利優勢，是合適的理想方案。
不過，有部分土地原為蘭嶼鄉公所於102年申請撥用作為「紅頭手工藝品中心」使用，經多次協調，蘭嶼鄉公所於日前同意辦理撥用，終促成「衛生福利部臺東醫院蘭嶼分院」用地取得。
衛生局指出，縣府推動在地醫療為主、空中轉診為輔政策，設置蘭嶼分院，一來可降低後送過程風險，二來在地就醫免除鄉親舟車勞頓之苦，未來蘭嶼分院與衛生所、長照結合的整體規劃，以及醫療診察科別設置等，都將邀請當地民眾參與意見，提供蘭嶼鄉親更完善、全面，且符合在地所需的醫療照護服務。