中央流行疫情指揮中心今天(29日)公布國內新增44,880例確定病例，分別為215例境外移入及44,665例本土個案，指揮中心表示，個案數比上週同期增加5.8%。另外，邊境開放第一階段今天(29日)起正式實施，10月13日第二階段如期實施。
國內本土病例新增223人為中症、50人為重症、53例死亡個案，其中有47例具慢性病史、31例沒有接種完整疫苗。最年輕死亡個案為18歲青少年，沒有接種疫苗，有先天性心臟病，長期使用氧氣。確診後意識不清，緊急插管轉入加護病房使用呼吸器，後續因肺炎不幸離世，重症部分新增4名罹患MIS-C，其中3位已出院、1例轉出加護病房，另外1例重症為心肌炎、肺炎併呼吸窘迫，在加護病房治療中。
國內疫情雖還在高原期，但沒有大幅增加趨勢，因此即日起入境檢疫3+4新制正式上路，發言人莊人祥表示，詳細內容已經放置在疾管署官網，包括入境前的準備作業、入境通關流程、3天居家檢疫4天自主防疫規定、快篩陽性後續流程，中英版本都有，提供入境旅客參閱。
考量國內疫情如預期且可控、次世代疫苗已開打、醫療量能防疫物資充足、邊境開放及各項整備順利，指揮官王必勝說，邊境開放第二階段10月13日如期實施，取消居家檢疫改以0+7，入境上限每週15萬人次，機場發放4劑快篩，無症狀可搭大眾交通工具，非免簽國開放一般社會訪問及觀光，旅行團部分取消限團令。
指揮中心表示，由於0+7不再需要居家檢疫，因此防疫旅館將全數回歸一般旅宿經營，交通部已加強溝通並於轉型期提供鼓勵措施，確診隔離需求由衛福部醫福會集中檢疫場所統籌，至於境外生與移工部分由教育部及勞動部研擬相關配套措施。
另外，今年採購的第四批Moderna次世代雙價疫苗60.5萬劑，已於今天上午抵達桃園國際機場，而國內將於10月3日起，開放給第二階段對象接種。指揮官王必勝表示，近期也會請ACIP專家會議討論，10月中旬進行下一階段對象規劃，預期依照年齡分階段安排，希望讓18歲以上民眾在年底前都能打到次世代疫苗。