為落實臺北市教育局校園安全政策，南港高中成立校安中心作為災害通報及緊急協處的運作平臺，整合協調校安事件通報及因應處置，鏈結轄區派出所、少年隊、少輔會、衛生局健康服務中心、社會局社福中心及學生校外生活輔導會等資源，建立互聯網絡互助合作，共同營造友善及安全的校園環境。
北市教育局學務校安室督導程允文表示，學校校安中心屬於校級跨處室整合單位，同時也涵蓋校內外資源的統合，例如當校園安全事件發生時，轄區派出所、少年隊以及輔導諮商中心將共同合作應處，當前學校在管理及輔導學生層面有許多困境，有賴校安中心掌握及應處；此外，除了平時的生活管理、天然災害、門禁安全、交通安全等都屬於校園安全管理範籌，需要由校安中心統合相關資源，透過校園安全支援協定與派出所保持密切合作，學生校外遇到重大問題由少年隊協助，遇到輔導諮商問題需要地區輔資中心與少輔會共同介入協處。
南港高中表示，校安中心確保學生校內外安全，同時為有效發揮校安中心空間與功能，將全民國防暨國軍人才招募管制辦公室納入運作，擔任國軍與本校推動全民國防教育的窗口，為全民國防的學校教育及社會教育共同努力，落實全民國防理念。