行政院災害防救辦公室、公共工程委員會及衛生福利部在今天(16日)的行政院院會中報告「馬太鞍溪堰塞湖災後復原情形」，行政院院長卓榮泰表示，馬太鞍溪堰塞湖災後應變處置已初步告一段落，但復原工作不能停止，未來工作將進行轉型，而對於可能在周末形成的「風神」颱風，卓榮泰院長表示，中央前進協調所已在昨天（15日）下午轉型為「中央緊急應變協調所」，以應變颱風可能帶來的侵襲。而面對天災，政府秉持「料敵從寬、禦敵從嚴」精神，落實各項防災準備作業流程，中央也會與地方攜手合作，以守護人民生命安全為最優先目標。
對於可能生成的「風神」颱風是否將正面侵襲臺灣，並對各地，特別是東部地區帶來影響，卓榮泰院長請中央氣象署務必加強監控，隨時提供最新、最正確資訊，也請地方政府及國人全力配合各項防颱措施。此外，行政院政務委員季連成目前正在「中央緊急應變協調所」協助花蓮縣政府在本週六（10月18日）進行可能的大規模撤離實地演練，由於颱風將至，演練等於實戰，請各部會在演練過程中，在人力、物力、交通、民生物資及醫療服務等各方面全力配合及投入，協助花蓮縣政府執行這項大規模疏散撤離任務。