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目前臺東縣設有太平溪人工濕地（臺東市）、東海人工濕地（臺東市）、關山人工濕地（關山鎮）、新良人工濕地（鹿野鄉），而目前環保局所操作維護的包含太平溪人工濕地及關山人工濕地。人工濕地顧名思義是人造的設施，主要功能為處理人工濕地周邊生活廢水、畜牧廢水及農業灌溉回歸水等污水。藉由人工濕地的「自淨作用」淨化污水，而自淨作用則是透過人工濕地中微生物、水生植物、藻類等存在人工濕地中的生物透過吸收、分解進流污水中的污染物。人工濕地內的生物吸收污染物後，會將污水中污染物轉化為生物的養分（像是微生物吸收污染物後會成長、繁衍），並成為底層食物鏈的營養輸入來源，不斷向上供給養分，建構穩健且多元的食物鏈。因此，人工濕地也具有生物棲地營造的功能性以及吸收大氣中二氧化碳的能力。